Table 1 Reference strains included in the evaluation of integron-screening LAMP assays

Class 1 integron positive microorganisms

361

Escherichia coli

109

+

-

-

Acinetobacter spp.

21

+

-

-

Pseudomonas aeruginosa

51

+

-

-

Klebsiella pneumoniae

28

+

-

-

Enterobacter cloacae

13

+

-

-

Staphylococcus aureus

92

+

-

-

S. epidermidis

16

+

-

-

S. haemolyticus

5

+

-

-

S. hominis

9

+

-

-

S. warneri

1

+

-

-

Enteroccus faecalis

9

+

-

-

E. faecium

2

+

-

-

Stretococcus spp.

5

+

-

-

Class 2 integron positive microorganisms

28

Pseudomonas aeruginosa

20

-

+

-

Escherichia coli

6

-

+

-

Proteus spp.

2

-

+

-

Class 1 and 2 integrons positive microorganisms

8

Pseudomonas aeruginosa

3

+

+

-

Enteroccus faecalis

2

+

+

-

Escherichia coli

3

+

+

-

Integrons negative microorganisms

685

Staphylococcus aureus

138

-

-

-

S. epidermidis

16

-

-

-

S. haemolyticus

7

-

-

-

S. hominis

8

-

-

-

S. capitis

1

-

-

-

S. saprophiticus

1

-

-

-

S. sciuri

1

-

-

-

S. schleiferi

1

-

-

-

S. intermedius

1

-

-

-

Listeria monocytogenes

58

-

-

-

L. invanovii

2

-

-

-

L. welshimeri

1

-

-

-

L. seeligeri

1

-

-

-

Bacillus cereus

6

-

-

-

Escherichia coli

121

-

-

-

Vibrio parahaemolyticus

108

-

-

-

V. vulnificus

1

-

-

-

V. mimicus

1

-

-

-

Pseudomonas aeruginosa

153

-

-

-

Salmonella enterica

44

-

-

-

S. typhimurium

2

-

-

-

S. choleraesuis

1

-

-

-

S. enteritidis

2

-

-

-

S. typhi

3

-

-

-

S. paratyphi

1

-

-

-

S. aberdeen

1

-

-

-

S. gallinarum

1

-

-

-

Klebsiella pneumoniae

1

-

-

-

Enterobacter cloacae

1

-

-

-

Yersinia enterocolitica

2

-

-

-

Total

1082